Josef Glatt-Eipert ist Diplom-Sozialpädagoge (FH), Mediator und Motopädagoge. Weiter ist er Mitglied der Bayerischen Regional-KODA und dort im Vorbereitungs- und Vermittlungsausschuss tätig. Er ist beisitzender Richter am Kirchlichen Arbeitsgericht Bayern und ehrenamtlicher Richter am Bundesarbeitsgericht in Erfurt. Seit 1993 engagiert er sich in verschiedensten MAVen (Bereich DiAG A und DiAG B) und ist Beisitzer in der Individualschlichtungsstelle der Diözese Eichstätt für den Bereich der verfassten Kirche.